就目前我国羊肚菌的基本裁培方式来看，大致分为三种：厢式裁培、垄式栽培和生态模式裁培。厢式栽培就是开厢种植的方法，种植羊肚菌前，先用石灰放线开厢，一般厢面宽90——110cm，厢与厢之间留有沟，沟宽30-40cm，沟深20-30cm；羊肚菌菌种播撒在厢面之上，用沟中泥土覆盖，一般覆盖5厘米。垄式裁培，在厢式栽培的基础上将厢面的宽度减少到20cm，便成了垄式栽培。垄式栽培和厢面裁培相比各有优缺点。厢式裁培播种方式为撒播，较为简单且相同面积的土地，厢数较少，减少人工；垄式裁培播种方式为沟播，即在垄上挖沟再播种的方式，相同面积土地，垄式栽培的方式形成的沟比较多，这相对于厢式栽培来说通气条件较好，但是水分散失也比厢式栽培快。生态栽培模式即林不栽培技术，播种前播种前浅翻林下土壤，然后直接将菌瓶内栽培种播撒至土壤中，播完后，覆盖腐殖土1-3cm，再在上面覆盖2cm的阔树叶，并施与重水。不同的地区所选择的树种不同，但一般所选的树种周旁都有过野生羊肚菌生长。和厢式栽培、垄式栽培相比，生态栽培模式更接近于野生羊肚菌的生存环境。羊肚菌不管是发菌期还是出菇期都不宜太阳光直射，因此不管哪一种栽培方式都必须进行遮阳处理。

在厢式裁培、垄式栽培和生态模式栽培的基础上，不同的地区根据当地的环境创造出不同的栽培方式。我国北方大部分地区为温带大陆性气候，冬季寒冷，夏季温热，气温日较差较大；降水量少，而且季节分配不均，集中在夏季。羊肚菌是一种低温、喜湿、好氧型真菌，在北方羊肚菌的栽培周期为10月至次年4月，正处冬季和春季，北方冬春气候干燥、气温低，空气湿度低这些特点限制了常规的羊肚菌栽培方法。

大棚裁培指在厢和垄地上方搭建大棚，并在大棚之上覆盖塑料薄膜。大棚栽培是比较适合北方栽培的栽培方式，覆盖塑料薄膜达到保温保湿的优点，但是薄膜的覆盖会导致空气流通不畅，所以大棚裁培应该注意定时通风。在南方一些地区，冬季气温低，有结冰期，但是结冰期时间较短，栽培羊肚菌时，发菌期处于结冰期，菌丝生长缓慢甚至停止生长，气候变暖时羊肚菌菌丝还没有成熟，等菌丝成熟的时候已经错过了出菇的最佳时期。这些地区一般采用覆膜裁培，覆膜栽培与大棚栽培极为相似。

覆膜裁培是指在厢面、垄上覆盖一层塑料薄膜的裁培方式，其和大棚栽培一样都有着保温保湿的作用，但是覆膜时间只能是在羊肚菌的发菌期，出菇期必须揭开地膜，大棚裁培则是贯穿羊肚菌的整个生育期。

套种栽培是指一种将羊肚菌和其他真菌或者植物一起裁培的栽培模式。小麦羊肚菌套种模式，其以厢式栽培为基础，在播种完羊肚菌并覆土后，将小麦种子撒于厢面之上。小麦和羊肚菌的生长互不干扰，而且小麦在幼苗时期能够为羊肚菌菌丝遮阳，同时起到保湿作用，若阳光过于强烈也要遮阳处理。羊肚菌灵芝套种模式，其也以厢面裁培为基础，在厢面两侧填埋已经发菌完成的灵芝椴木，在厢面播种羊肚菌并覆土，灵芝菌丝分解纤维素为羊肚菌提供一定的营养，两种菌丝共同改善土壤环境协同生长，羊肚菌和灵芝均不能强光照射，所以这种栽培方式必须遮阳。